负责机关日常运转，承担文秘、信息、政务公开、信访、会务、机要、保密、档案、后勤等工作。负责人大政协建议提案和领导重要批示件的督办工作。承担干部人事管理、机构编制工作。负责离退休干部服务管理工作。负责财务管理和内部审计工作。

负责港口总体规划、港区控制性详细规划和航道、水路交通建设（不含陆岛交通码头）等专项规划的编制、实施和监管工作。依法实施航道管理工作，负责航道保护范围的划定、专用航道的业务监督指导、涉航建筑物事中事后监督管理。负责港口岸线使用和港口项目投资管理。负责水运建设市场、水运工程建设项目、水运工程质量和安全生产的监督管理工作（不含陆岛交通码头）。

负责规范性文件、对外合同、重大行政决策的合法性审核。承办行政复议、行政应诉等相关工作。承担政府法律顾问管理工作。负责执法监督、执法人员资格管理和培训考核工作。牵头负责港航信用体系建设、普法宣传工作。牵头推进行政审批制度改革和“最多跑一次”等综合交通改革相关工作，负责行政许可、日常管理服务类事项的审批、核准、备案等工作。

负责港口经营市场监管工作。负责港口经营企业诚信机制和服务质量评价体系建设。负责港口安全生产和应急管理工作。负责港口设施保安履约工作的监管。负责协调国家重点物资、军事和抢险救灾物资的疏港工作。督促指导港口及其岸线生态保护及修复、港口企业节能减排和污染防治工作。

负责水路货物运输市场的监管工作。负责水路货物运输企业诚信机制和服务质量评价体系建设。负责开展水路货物运输及辅助业务的监督管理工作。督促指导水路货物运输企业及船舶管理企业安全生产和应急管理工作。组织协调关系国计民生物资的紧急运输。督促指导水路货物运输企业节能减排、污染防治工作。

工作职责：负责拟定并组织实施口岸发展规划、口岸查验机构设置规划。负责口岸开放项目的审查、申报、对外启用验收和关闭的组织协调工作。协调推进国际贸易“单一窗口”建设工作。协调指导口岸建设、管理，推进口岸精神文明建设。协调口岸通关工作，会同有关部门加强对涉外服务企业的管理，维护口岸正常运营秩序。承担市口岸工作领导小组办公室的日常工作。

负责拟定并组织实施反走私年度工作计划。组织协调全市反走私综合治理工作。组织协调有关部门开展专项斗争和联合行动，指导、协调走私大要案件及疑难案件的查处，协调处置有关反走私的突发应急事件。受理反走私工作来信来访和举报。加强反走私工作调研，掌握工作动态，提出工作措施与建议。负责反走私宣传、督查等工作。承担市反走私综合治理领导小组办公室的日常工作。