负责机关日常运转，承担文秘、信息、政务公开、督查、信访、会务、机要、保密、档案、安全、后勤、财务等工作。组织起草综合性材料、重要文件。负责国防科技动员工作。负责人大政协建议提案和领导重要批示件督办工作。负责机关和所属单位干部人事管理、机构编制、离退休干部服务管理等工作。指导科技系统队伍建设。

提出科技成果转移转化及产业化、促进产学研深度融合、科技知识产权创造的相关政策措施建议，推动科技服务业、技术市场发展。承担科技发展、科技安全和科技保密相关工作。负责科学技术表彰和奖励的组织、推荐工作。引导社会力量设立科学技术奖，并负责业务指导和事中事后监管。承担推进科技体制改革相关工作，拟订科技创新政策措施，组织参与起草相关地方性法规、规章草案并开展普法宣传。承担规范性文件、合同、重大行政执法决定、重大行政决策等合法性审核工作。承担行政复议、行政应诉等工作。承担政府法律顾问管理工作。组织开展县（区）党政领导科技进步目标责任制考核。会同相关部门开展人才工作目标责任制考核。负责组织重大科技决策咨询相关工作。

拟订高新技术发展及产业化规划和政策，组织开展相关领域技术发展需求分析，提出重大任务并组织实施。牵头组织高新技术企业、科技型中小企业等培育建设工作，推进企业科技研发机构建设。提出相关领域平台、基地规划布局并组织实施。拟订科技创新发展规划并协调实施。指导和协调推进高新区等科技创新大平台建设。拟订科技资源合理配置政策措施，牵头管理年度国家级、省级和市级科技计划，实施科技报告制度。承担科技统计、创新调查和创新监测分析工作。承担科技金融相关工作。牵头负责市科技专项经费的预决算执行和监督。承担科技监督评价体系建设和科技评估管理相关工作，提出科技评价机制改革的政策措施建议并监督实施，开展科技评估评价和监督检查工作。承担科研诚信建设工作。拟订基础研究规划、政策、标准并组织实施，协调基础研究和应用基础研究。推进重点实验室等科技创新基地、科研条件建设和科技资源开放共享。参与编制重大科技基础设施规划和监督实施。指导推进科研机构改革发展。

拟订科技促进农业农村和社会发展领域科技创新的规划和政策，组织开展农业领域和社会发展领域技术发展需求分析，提出重大任务并组织实施。提出相关领域平台、基地规划布局并组织实施。负责科技扶贫相关工作。负责将安全生产科技进步纳入科学技术发展规划，并组织实施。承担市科技特派员办公室的日常工作。

拟订引进国外智力、科技人才队伍建设和科技合作的规划、政策及措施并组织实施。组织实施和管理重点引进国（境）外人才智力项目引进推广工作，规范引进国（境）外人才智力中介组织。负责外国专家来华工作行政许可和公共服务。归口管理全市因公出国（境）培训。承担相关科技人才计划实施和人才评价工作。在授权范围内协调管理全市科技外事工作。实施国内外科技合作项目，推动建设科技合作载体。牵头推进引进大院名校共建科技创新载体。承担科技对口支援相关工作。承担中国（舟山）海洋科学城建设领导小组（中国海洋科技创新引智园区舟山联席会议）办公室的日常工作。