舟山市中心血站于1987年11月经省卫生厅和市政府批准，由原舟山市输血管理站改建而成，是直属市卫生和计划生育局领导的纯公益性全民事业单位。市中心血站是舟山市唯一一家采供血机构，承担全市采供血业务工作，是浙江海洋大学医学院输血专业教育基地，担负全市临床医疗输血的技术指导任务。2018年1月搬迁至新城千岛街道体育路288号，新址实际使用面积4668平方米。其中行政用房750平方米，业务用房3918平方米。内设办公室、体采科和检验科。现有在岗工作人员37人（卫生计生人员27名），其中高级职称3人，中级职称8人；本科15人，专科9人。
《中华人民共和国献血法》实施以来，舟山市无偿献血工作在各级政府关心支持下，市献血办、市中心血站干部职工及时转变观念，调整服务理念，下小岛乡镇开展采血服务并进行无偿献血宣传，每年漂洋过海在30多个岛屿上宣传采血100余次，临床用血100%来自无偿献血，保证了全市临床用血需要和血液安全。我市也因此连续五次被浙江省人民政府授予“无偿献血先进市”荣誉称号。