牵头研究提出健康舟山建设、爱国卫生运动的规划、政策、措施的建议，并组织实施。组织开展卫生健康教育与促进活动，承担卫生健康科学普及工作。承担《烟草控制框架公约》牵头履约工作。组织开展健康舟山和爱国卫生运动考核评价工作。承担市爱国卫生运动委员会办公室、市国家卫生城市管理工作领导小组办公室的日常工作。